肽定制产品与服务公司Pepscan及其CLIPS技术
TiPLab 木山
2020-04-10

Pepscan Systems B.V.成立于2000年,是一家位于荷兰的生物技术公司,主要提供基于肽的定制产品与服务,包括针对肽的识别与优化、合成定制肽、合成肽文库以及肽库筛选等。Pepscan公司专门研究约束肽,并且拥有CLIPS(Chemical

Pepscan致力于提供用于开发新型多肽药物的约束肽

Pepscan是一家位于荷兰的生物技术公司,获得了ISO 9001:2015认证,主要提供基于肽的定制产品与服务,其研究方向主要在蛋白质模拟和构象约束肽方面。Pepscan的主营业务包括:针对肽的识别与优化、合成定制肽、合成肽文库以及肽文库筛选等。

Pepscan专门研究约束肽,拥有CLIPS约束肽技术的核心专利。而双环“2-CLIPS”肽是新一代的生物治疗药物代表之一,在具有小分子特性的同时也兼具了类似抗体的亲和力和选择性。

以CLIPS技术为中心的平台技术

Pepscan的CLIPS(Chemical Linkage of Peptides onto Scaffolds)技术可用于约束肽的3D构象。与其他约束方法不同,CLIPS技术可创建单环、双环或三环形式的肽。

CLIPS技术通过化学修饰使一个或多个肽段以特定构象稳定存在,模拟复杂蛋白特定结构域的天然构象,替代全长受体进行药物筛选。

CLIPS技术涉及通过半胱氨酸的巯基官能团(SH)与特定的(杂)芳族分子反应来实现线性肽的环化。该(杂)芳族分子能与硫醇反应,并通过共价键与肽连接。环化反应持续时间不超过30分钟,在室温下进行,且不需要催化。

2-CLIPS肽是一种双环肽,其特异性可与抗体媲美,但它的大小要比抗体要小得多(1.5–2 kDa),而且可以通过化学合成得到。

肽文库可用于快速经济高效地识别筛选关键的生物活性肽。为了充分发挥2-CLIPS化合物类别的潜力,Pepscan开发了一种方法来制备2-CLIPS肽文库,即2-CLIPS肽的Hit Seeker肽库。2-CLIPS肽的Hit Seeker库可用于第三方筛选,针对特定靶标对可溶性2-CLIPS肽文库进行功能筛选,能够发现有效的2-CLIPS肽药物。

HiSense阵列是Pepscan的超灵敏阵列平台,该平台可用于识别和优化肽。通过将CLIPS/HiSense平台技术应用于选定的肽,可以使筛选得到的肽的亲和力提高几个数量级(可达到1000倍),从而大大提高了生物活性。

Pepscan专有的CLIPS技术、Hit Seeker肽库和HiSense阵列相结合,形成了一个独特的技术平台,可应用于各种基于肽的药物发现和优化项目,例如治疗性肽的合成、抗体的发现和治疗性疫苗的生产。

围绕平台技术的专利保护

2004年2月26日,Pepscan公司基于EP03075597A的优先权,递交了PCT专利申请PCT/NL2004/000146,在此基础上,Pepscan分别向EP、US等多个专利局递交相应的专利申请。该专利家族针对CLIPS平台技术,从基础的制备方法、化合物、在制备文库上的应用等多个层面分别进行了专利保护。下面我们将从其US专利分析其专利保护情况。

涉及环状肽的制备方法——US8748105B2

2005年8月26日,Pepscan递交了PCT国际申请PCT/NL2004/000146在美国的延续申请,其授权专利号为US8748105B2。

US8748105B2保护了一种合成化合物的方法。

独立权利要求1首先限定了合成的化合物结构为通过至少两个硫醚键(杂)芳族分子连接的肽结构。

同时,关于具体的合成方法,权利要求1限定了实现该方法所必需的分子:即包含双,三或四(卤代甲基)的(杂)芳族分子-取代的(杂)芳环系统;包含具有侧链的氨基酸的肽,并限定肽至少具有两个SH官能团

独权1还限定了反应条件,为使上述两种反应物在包含至少50%水的缓冲水溶液中接触,在偶联反应中形成至少两个硫醚键

在前面的讨论中,我们提到CLIPS技术的实质即为特定的(杂)芳族环分子与具有多个SH官能团的肽在缓冲水溶液中发生偶联反应,US8748105B2的权利要求限定了实现该方法必需的分子与反应条件等,在保留必要技术特征的基础上不再做其它多余的限定,从而获得尽可能宽泛的保护范围

涉及包含环状肽结构的化合物——US8742070B2

除了制备方法之外,Pepscan还对包含双(多)环肽的产品进行了保护,比如:US8742070B2。 US8742070B2是US8748105B2的分案,其权利要求1保护了一种包含至少两个环状肽结构的化合物,限定了两个环状肽结构通过至少三个硫醚键与(杂)芳族分子连接,且限定了硫醚键在(杂)芳族分子的苯甲基位置包含硫元素。

US8742070B2的权利要求保护的是通过CLIPS技术生产得到的其中一种肽产品,即通过硫醚键与(杂)芳族分子连接的双环肽。

US8742070B2对双(多)环肽的结构进行了保护,从产品角度阻碍竞争对手以生产经营为目的制造、销售、许诺销售或进口的行为

涉及制备肽文库的方法——US9176127B2

US9176127B2也是US8748105B2的分案,保护了一种制备文库的方法。

肽文库是Pepscan公司提供的一项基于肽的定制产品,且肽文库是面向不同客户特别定制的,因此Pepscan对制备文库的方法提出了专利申请。

US9176127B2的权利要求1首先限定了该文库的构成,即包含通过硫醚键与(杂)芳族分子连接的肽结构组成的多种化合物。其次,权利要求1进一步限定了生产至少两种上述化合物的方法,对实现该方法所需要的原料、反应条件等必要技术特征作了限定。

US9176127B2能够直接保护Pepscan提供的定制肽文库的制备方法,阻止竞争对手提供相同的服务或直接使用相同的方法

基础制备方法与产品的双重专利保护

Pepscan公司围绕CLIPS等平台技术,从不同保护角度申请了专利,保护其相关的基础制备方法、得到的相应产品以及在制备文库上的应用。

首先,关于CLIPS技术最基础的制备方法,只保留关键的必要技术特征,尽可能获得比较宽泛的保护范围;其次通过保护CLIPS技术获得的产品与在制备文库上的应用,在增强围绕CLIPS技术的专利布局的稳定性的同时,也更具有针对性地保护了Pepscan公司提供的对应的定制产品与服务。

针对平台技术的专利布局,具体的实现方法往往是其基础的核心专利,而其他保护相应产品或应用等相关专利是对公司资产的另一重保护,能够具体保护公司的产品或服务,因此同样值得重视

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